MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187106	C	7	7	6	12	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NT_187106	TGGG	2	8	16	23	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187106	TAA	2	6	72	77	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187106	CGT	2	6	103	108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
5	NT_187106	TTC	2	6	176	181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
6	NT_187106	CAC	2	6	215	220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
7	NT_187106	CCG	2	6	232	237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
8	NT_187106	GGATAA	2	12	241	252	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409250881
9	NT_187106	AC	3	6	289	294	50 %	0 %	0 %	50 %	409250881
10	NT_187106	ATC	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250881
11	NT_187106	CGC	2	6	496	501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
12	NT_187106	GAT	2	6	506	511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
13	NT_187106	AG	3	6	513	518	50 %	0 %	50 %	0 %	409250881
14	NT_187106	ACGG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	409250881
15	NT_187106	TCT	2	6	591	596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
16	NT_187106	CAC	2	6	605	610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
17	NT_187106	TCG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
18	NT_187106	CGT	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
19	NT_187106	ATA	2	6	702	707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250881
20	NT_187106	CGG	2	6	709	714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
21	NT_187106	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
22	NT_187106	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
23	NT_187106	CGTT	2	8	828	835	0 %	50 %	25 %	25 %	409250881
24	NT_187106	GCA	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
25	NT_187106	GAC	2	6	865	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
26	NT_187106	CG	4	8	871	878	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
27	NT_187106	CCA	2	6	967	972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
28	NT_187106	TCT	3	9	990	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
29	NT_187106	CG	3	6	1005	1010	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
30	NT_187106	CAC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
31	NT_187106	ACA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250881
32	NT_187106	ACG	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
33	NT_187106	GCA	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
34	NT_187106	TCG	2	6	1287	1292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
35	NT_187106	CGCCTG	2	12	1346	1357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250881
36	NT_187106	TCAG	2	8	1362	1369	25 %	25 %	25 %	25 %	409250881
37	NT_187106	CACG	2	8	1384	1391	25 %	0 %	25 %	50 %	409250881
38	NT_187106	TCA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250881
39	NT_187106	GC	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
40	NT_187106	GCA	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
41	NT_187106	GC	3	6	1516	1521	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
42	NT_187106	GC	3	6	1585	1590	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
43	NT_187106	ACG	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
44	NT_187106	CAC	2	6	1631	1636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
45	NT_187106	CGG	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
46	NT_187106	ATG	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
47	NT_187106	CCA	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
48	NT_187106	ATT	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250881
49	NT_187106	CAC	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
50	NT_187106	GC	3	6	1843	1848	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
51	NT_187106	GC	3	6	1901	1906	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
52	NT_187106	GAT	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
53	NT_187106	CG	3	6	1979	1984	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
54	NT_187106	CGGTA	2	10	2011	2020	20 %	20 %	40 %	20 %	409250881
55	NT_187106	CTT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
56	NT_187106	ACG	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
57	NT_187106	TGA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
58	NT_187106	CGG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
59	NT_187106	GCG	2	6	2164	2169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
60	NT_187106	TCG	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
61	NT_187106	GAA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250881
62	NT_187106	CAG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
63	NT_187106	T	6	6	2254	2259	0 %	100 %	0 %	0 %	409250881
64	NT_187106	GCC	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
65	NT_187106	CCA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
66	NT_187106	ACGA	2	8	2444	2451	50 %	0 %	25 %	25 %	409250881
67	NT_187106	T	6	6	2522	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	409250881
68	NT_187106	CAA	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250881
69	NT_187106	TC	3	6	2697	2702	0 %	50 %	0 %	50 %	409250881
70	NT_187106	CT	3	6	2832	2837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187106	ATT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187106	ATA	2	6	3207	3212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
73	NT_187106	ATG	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250882
74	NT_187106	AAT	2	6	3288	3293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
75	NT_187106	CCG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
76	NT_187106	GTG	2	6	3370	3375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250882
77	NT_187106	TTTC	2	8	3402	3409	0 %	75 %	0 %	25 %	409250882
78	NT_187106	CCG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
79	NT_187106	GTT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250882
80	NT_187106	TTC	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250882
81	NT_187106	AAAG	2	8	3590	3597	75 %	0 %	25 %	0 %	409250882
82	NT_187106	ATA	2	6	3670	3675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
83	NT_187106	CAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
84	NT_187106	CGAT	2	8	3802	3809	25 %	25 %	25 %	25 %	409250882
85	NT_187106	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
86	NT_187106	CGC	2	6	3861	3866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
87	NT_187106	TCA	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
88	NT_187106	C	6	6	3908	3913	0 %	0 %	0 %	100 %	409250882
89	NT_187106	A	6	6	4049	4054	100 %	0 %	0 %	0 %	409250882
90	NT_187106	T	6	6	4106	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	409250882
91	NT_187106	CAAT	2	8	4136	4143	50 %	25 %	0 %	25 %	409250882
92	NT_187106	TGA	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250882
93	NT_187106	AGG	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250882
94	NT_187106	T	8	8	4283	4290	0 %	100 %	0 %	0 %	409250882
95	NT_187106	TTTG	2	8	4362	4369	0 %	75 %	25 %	0 %	409250883
96	NT_187106	T	6	6	4375	4380	0 %	100 %	0 %	0 %	409250883
97	NT_187106	T	6	6	4382	4387	0 %	100 %	0 %	0 %	409250883
98	NT_187106	AATA	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	409250883
99	NT_187106	TTA	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250883
100	NT_187106	TAA	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
101	NT_187106	AAT	2	6	4572	4577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
102	NT_187106	ATC	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250883
103	NT_187106	GCA	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
104	NT_187106	CCA	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250883
105	NT_187106	AGT	2	6	4867	4872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250883
106	NT_187106	GCC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250883
107	NT_187106	AGC	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
108	NT_187106	GAAA	2	8	4910	4917	75 %	0 %	25 %	0 %	409250883
109	NT_187106	GAAA	2	8	4947	4954	75 %	0 %	25 %	0 %	409250883
110	NT_187106	TTTA	2	8	4970	4977	25 %	75 %	0 %	0 %	409250883
111	NT_187106	TTA	2	6	5010	5015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250883
112	NT_187106	CTG	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250883
113	NT_187106	TAAA	2	8	5075	5082	75 %	25 %	0 %	0 %	409250883
114	NT_187106	GCCAGC	2	12	5131	5142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250883
115	NT_187106	GAT	2	6	5171	5176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250883
116	NT_187106	GAA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250883
117	NT_187106	ATA	2	6	5279	5284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
118	NT_187106	A	7	7	5322	5328	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
119	NT_187106	A	8	8	5363	5370	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
120	NT_187106	ATA	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
121	NT_187106	ATATG	2	10	5471	5480	40 %	40 %	20 %	0 %	409250883
122	NT_187106	AGA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250883
123	NT_187106	GA	3	6	5525	5530	50 %	0 %	50 %	0 %	409250883
124	NT_187106	TTCA	2	8	5531	5538	25 %	50 %	0 %	25 %	409250883
125	NT_187106	GCA	2	6	5547	5552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
126	NT_187106	A	6	6	5582	5587	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
127	NT_187106	ACT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250883
128	NT_187106	A	6	6	5727	5732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187106	AT	3	6	5766	5771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187106	AGCA	2	8	5773	5780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NT_187106	AAC	2	6	5801	5806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187106	AT	3	6	5836	5841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187106	ATTA	2	8	5864	5871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187106	GGA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187106	GAA	2	6	5900	5905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187106	GAT	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250884
137	NT_187106	GTAA	2	8	6066	6073	50 %	25 %	25 %	0 %	409250884
138	NT_187106	CAT	2	6	6128	6133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250884
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163	NT_187106	ATC	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NT_187106	CTG	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250886
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254	NT_187106	ATC	2	6	11977	11982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250889
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262	NT_187106	A	6	6	12490	12495	100 %	0 %	0 %	0 %	409250889
263	NT_187106	AGAGA	2	10	12499	12508	60 %	0 %	40 %	0 %	409250889
264	NT_187106	CCCA	2	8	12538	12545	25 %	0 %	0 %	75 %	409250889
265	NT_187106	TAA	2	6	12651	12656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250889
266	NT_187106	A	6	6	12671	12676	100 %	0 %	0 %	0 %	409250889
267	NT_187106	A	6	6	12678	12683	100 %	0 %	0 %	0 %	409250889
268	NT_187106	ATA	2	6	12685	12690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250889
269	NT_187106	ACTA	2	8	12693	12700	50 %	25 %	0 %	25 %	409250889
270	NT_187106	TTTC	2	8	12734	12741	0 %	75 %	0 %	25 %	409250889
271	NT_187106	GCTCA	2	10	12780	12789	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
272	NT_187106	ATTA	2	8	12887	12894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NT_187106	ACT	2	6	18501	18506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250894
398	NT_187106	GCG	2	6	18515	18520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250894
399	NT_187106	CAG	2	6	18541	18546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250894
400	NT_187106	CGC	2	6	18563	18568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250894
401	NT_187106	CGT	2	6	18642	18647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250894
402	NT_187106	CG	3	6	18781	18786	0 %	0 %	50 %	50 %	409250894
403	NT_187106	GAA	2	6	18814	18819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250894
404	NT_187106	CTG	2	6	18829	18834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250894
405	NT_187106	ACG	2	6	18836	18841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250894
406	NT_187106	ATC	2	6	18874	18879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250894
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408	NT_187106	GC	3	6	18944	18949	0 %	0 %	50 %	50 %	409250894
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412	NT_187106	TGAAG	2	10	19053	19062	40 %	20 %	40 %	0 %	409250894
413	NT_187106	CTT	2	6	19161	19166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250894
414	NT_187106	TAG	2	6	19167	19172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250894
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432	NT_187106	GGC	2	6	19934	19939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250895
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444	NT_187106	ACG	2	6	20868	20873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
445	NT_187106	AAT	3	9	20952	20960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NT_187106	AAT	2	6	20974	20979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NT_187106	AT	3	6	21007	21012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NT_187106	TAA	3	9	21020	21028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NT_187106	TACAT	2	10	21047	21056	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
450	NT_187106	AT	3	6	21099	21104	50 %	50 %	0 %	0 %	409250896
451	NT_187106	AGA	2	6	21157	21162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250896
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455	NT_187106	A	7	7	21473	21479	100 %	0 %	0 %	0 %	409250896
456	NT_187106	CAGA	2	8	21518	21525	50 %	0 %	25 %	25 %	409250896
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463	NT_187106	A	6	6	21795	21800	100 %	0 %	0 %	0 %	409250896
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469	NT_187106	ATG	2	6	22161	22166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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471	NT_187106	TA	3	6	22187	22192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NT_187106	GCG	2	6	22296	22301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250897
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497	NT_187106	AGA	2	6	23483	23488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
498	NT_187106	AGG	2	6	23500	23505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
499	NT_187106	CGA	2	6	23515	23520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NT_187106	CG	3	6	23665	23670	0 %	0 %	50 %	50 %	409250898

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